Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf2Q59J78 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms