Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
R3hdm4Q4VBF2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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