Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Snx25Q3ZT31 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Snx25Q3ZT31 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Snx25Q3ZT31 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Snx25Q3ZT31 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Snx25Q3ZT31 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Snx25Q3ZT31 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Snx25Q3ZT31 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Snx25Q3ZT31 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms