Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms