Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms