Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ttc9Q3V038 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ttc9Q3V038 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ttc9Q3V038 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ttc9Q3V038 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms