Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms