Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pfdn4Q3UWL8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pfdn4Q3UWL8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pfdn4Q3UWL8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pfdn4Q3UWL8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pfdn4Q3UWL8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pfdn4Q3UWL8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pfdn4Q3UWL8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pfdn4Q3UWL8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pfdn4Q3UWL8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pfdn4Q3UWL8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pfdn4Q3UWL8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn4Q3UWL8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn4Q3UWL8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn4Q3UWL8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn4Q3UWL8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn4Q3UWL8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn4Q3UWL8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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