Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
D130052B06RikQ3UW13 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms