Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6899Q3USS0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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