Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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