Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULJ3

Upf3a, MCG3697, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3aQ3ULJ3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upf3aQ3ULJ3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms