Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms