Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms