Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr41Q3UDP0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms