Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Cops9Q3U898 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cops9Q3U898 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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