Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc174Q3U155 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms