Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms