Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Uri1Q3TLD5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms