Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna5Q2MKA5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms