Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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Cers3Q1A3B0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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