Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q149G0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q149G0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q149G0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms