Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms