Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms