Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms