Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms