Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms