Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms