Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms