Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MestQ07646 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MestQ07646 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MestQ07646 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms