Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms