Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms