Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms