Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms