Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mex3cQ05A36 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms