Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SryQ05738 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SryQ05738 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SryQ05738 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SryQ05738 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SryQ05738 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SryQ05738 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SryQ05738 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SryQ05738 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SryQ05738 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SryQ05738 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SryQ05738 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SryQ05738 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SryQ05738 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SryQ05738 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SryQ05738 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SryQ05738 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SryQ05738 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SryQ05738 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SryQ05738 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SryQ05738 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SryQ05738 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SryQ05738 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SryQ05738 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms