Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms