Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms