Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms