Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms