Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs2Q03350 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms