Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms