Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms