Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms