Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms