Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms