Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms