Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms