Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms