Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms